Fox Mulder, interpretado por David Duchovny, es Agente Especial del FBI, compañero de Dana Scully, y le apodan Spooky (Siniestro) por sus creencias en fenómenos paranormales y en una conspiración por parte del Gobierno de los Estados Unidos para ocultar o negar la verdad de la existencia de vida extraterrestre. Trabaja en los "Expedientes X", casos con circunstancias particularmente misteriosas y posiblemente sobrenaturales. Mulder considera que el mayor propósito de su vida son Los Expedientes Secretos X y la búsqueda para revelar la conspiración del gobierno. Sus padres son Bill Mulder y Teena Mulder , nació el 13 de octubre de 1961. El 27 de noviembre de 1973, Samantha Mulder su hermana,desaparece misteriosamente. El cuerpo de Samantha comienza a flotar delante de Fox y se dirige hacia una luz brillante en el exterior. Fox queda paralizado cuando ve a una figura con forma de extraterrestre en la entrada. Mulder accede a estos recuerdos gracias a una sesión de hipnosis con el Dr. Werber en 1989. En 1983 entra en la Universidad de Oxford para estudiar psicología. Más tarde se une a la academia del FBI en Quantico (Virginia.) Se sabe que Mulder entra al FBI -motivado por el deseo de investigar la desaparición de su hermana y el 24 de octubre de 1986, Mulder empieza a trabajar en la Unidad de Ciencias del Comportamiento, donde hace perfiles de asesinos en serie, durante unos tres años. Durante este tiempo, Mulder se convierte en el mejor realizando perfiles psicológicos de los más violentos asesinos, perfiles que casi siempre llevan a su detención. Gracias a esto, a pesar de su reputación como "spooky", logra hacerse de cierto prestigio dentro del FBI. Empieza a trabajar como agente de campo de la división de crímenes violentos con el agente Reggie Purdue. En mayo de 1989, Mulder es rociado con una droga experimental que causa alucinaciones y paranoia, lo que aumenta su interés por los extraterrestres y las conspiraciones. Es apartir de entonces cuando Mulder comienza a mostrar un interés fanático en lo paranormal.